Я всё не могла понять, какой смысл может быть в том, что вернуть Пондов в ТАРДИС после всего, что было, и не станет ли это последней каплей в чаше эмоциональной неверибельности. О внутренней логике в любом случае говорить пока рано, но логику внешнюю, идейную, проследить можно. На ГБ я наткнулась на довольно убедительную мысль по этому поводу.

История Пондов получила, казалось бы, логичное завершение в "Комплексе Бога". Или даже раньше.
Сначала это была история взросления, становления Эми, её пути к гармонии между сказкой и реальностью. И эта история вроде бы закончилась ещё в 5 сезоне, хотя Эми и не дошла на этом пути вперёд и вверх до самого конца. С одной стороны, свадьба - это правильный окончательный финал, а с другой, можно было присмотреться и увидеть, что Эми ещё есть, что взять от Доктора.
6 сезон стал историей о том, что от Доктора нужно вовремя уйти. Да, сразу после свадьбы; это было прописано предельно ясно. До самого конца нам и Доктору рассказывали о том, что он несёт боль и разрушение. Именно на этой ноте он оставил Пондов, когда заставил себя понять и принять то, как он для них опасен. И это было логично и правильно.
За исключением одного.
В итоге 6 сезон оказался как раз об обратном. О том, что Доктор опасен, но, несмотря на это, несёт добро, и Вселенная в любой момент готова встать на его защиту. Вот чем всё кончилось: Доктору точно так же пришлось принять, что он любим, что он важен и нужен. И что те, кто оказались рядом с ним, рады, что так случилось. А потому всё то, что развело его с Пондами, логично, но не правильно, и не так важно, как то счастливое, что было у них вместе.

Мне на протяжении всего поста хотелось употребить какое-нибудь слово типа "нарратив", но я не совсем знаю, что это значит, так что лучше с бесконечными повторами "истории" и "идеи", чем с уходом в беспощадную терминологию